中心成立以来，始终坚持走内涵发展之路。2004年，中心作为全省唯一的县级市参加卫生部“全国地、县级疾控机构规范化建设研究”，实施高血压、艾滋病防制等9个疾病预防防制项目的标准化管理模拟运作，其软硬件建设被国家卫生部列为全国县级疾控机构的建设模板。2007年率先在全省县级疾控机构中建立了荧光定量PCR实验室，将微生物检测提高到分子水平，从而有效提高了传染病疫情和食物中毒等突发事件的病原体检出率，并使检测周期从传统检测法的3—10天缩短至4小时左右，为实现快速处置突发事件提供了有力的技术支撑。配置了全自动生化分析仪、高压液相色谱仪、气相色谱仪、离子色谱仪、自动微生物鉴定和药敏测试仪等一批精密仪器设备。近几年来陆续引进OA办公系统、卫生检测、从业人员体检、职业健康监护、慢病量化管理、死因监测、收费应用等软件系统，实施计算机信息化管理，大大提高了疾控工作效率。2009年8月通过中国合格评定国家认可委员会（CNAS）和江苏省技术监督局组织的实验室能力认可/实验室资质认定联合（扩项）评审。2010年1月，中心搬迁至张家港市公共卫生中心，总建筑面积达14000平方米，其中实验室用房近8000平方米，拥有贝克曼DXC800全自动生化分析仪、ATB微生物自动鉴定及药敏测试仪、爱普拜斯ABi7900荧光定量PCR仪、色谱质谱联用仪、气相色谱仪、高压液相色谱仪等精密仪器200余台，可进行常量、微量化学分析、微生物检验鉴定、室内环境等方面的检测，经认可/认证的检测项目总数达到省内同级机构前列。 张家港市疾病预防控制中心于2002年1月，在原卫生防疫站、皮肤病防治所、结核病防治所基础上组建而成，是由政府举办的实施疾病预防控制与公共卫生技术管理和服务的公益性全民事业单位，同时对外挂牌“张家港市卫生检测中心”、“张家港市食品安全检测中心食品污染物（含食源性疾病）检测分中心”，是我市唯一一家集疾病预防与控制、检验检测与评价、健康教育与促进、应用研究和指导、技术管理和服务为一体的卫生防病单位。 中心现有在编职工120名，其中卫技人员97名，占职工总数的80.8％，高级卫生技术人员15名、中级48名，占卫技人员总数的64.9％。形成了人员职称、年龄结构比较合理的专业技术队伍，为中心的可持续发展提供了充足的人才保证。 近年来，中心加强与省内外科研机构和高等院校的合作，并相继成为东南大学和苏州大学的教学实习基地，依托高校资源和科技平台，科研工作不断取得新进展。先后获卫生部、省市级多项科研成果，其中卫生部医药卫生科技进步二等奖1项、省卫生厅科技进步一、四等奖各1项、苏州市科技进步四等奖1项，在省级以上杂志发表论文256篇，参与编写专著5部。其中1998年《中华按蚊为媒介地区疟疾防治后期流行新特点和监测方案研究》获卫生部医学卫生科技进步二等奖；1999年与中国预防医学研究院微生物与流行病学研究所合作的课题《中国人群吸烟率及相关行为的流行病学研究》获卫生部科技进步二等奖；2000年《张家港市卫生改水成果与今后发展研究》获2000年度张家港市人民政府科技成果二等奖和苏州市人民政府科技进步四等奖；2004年《综合医院建设项目卫生学预评价研究》成果获张家港市科技进步“双杯奖”；2005年《慢性非传染性疾病预防与控制》项目成果获苏州市科技进步奖三等奖；2007年《疾病预防控制管理体系工作研究》获得苏州市科技进步双杯奖；2008年《单纯性肥胖儿童健康状况及相关因素研究》课题获得苏州市科技成果进步奖三等奖，《突发公共卫生应急体系研究》获得张家港市科技成果进步奖二等奖；2009年编撰出版《疾病预防控制“三基”》及其配套《试题集》填补国内空白，《有毒化学品作业场所职业病危害现状及防治对策研究》获得张家港市科技成果进步奖二等奖，《对基层疾病预防控制工作人员“三基”培训的研究》获得张家港市科技成果进步奖三等奖。并有《突发危险化学品事故防范与应急救援技术体系研究》课题获市科技局立项批准，《张家港市儿童青少年身高体重的十年回顾与发展趋势分析》和《张家港市糖尿病社区个体化综合干预措施研究》分别列入张家港市2009年社会发展科技指导性项目，有效带动了疾控软实力的提升。 近年来，市委、市政府高度重视我市疾病预防控制体系建设，将疾控体系建设纳入重要议事日程，目前，目前已形成了以市疾控中心为核心、镇卫生管理服务中心为纽带、社区卫生服务站为基础的三级预防保健网络，一个较为完善的疾病预防控制体系已建成。在此基础上，中心根据我市主要公共卫生问题，突出防治重点，拓展预防控制领域，依托社区不断深化慢性非传染性疾病的防治工作，采取综合措施狠抓重大传染病防治，全面落实现代结核病控制策略，全力抓好扩大免疫规划和流动儿童预防接种管理，有效应对传染病疫情、食物中毒等突发公共卫生事件，疾病预防控制综合能力不断提升，为全市社会经济的协调发展和群众健康素质的稳步提升作出了不懈努力。2003年获得江苏省卫生厅首批县级市唯一的职业卫生技术服务机构、职业健康检查机构资质；2005年代表江苏省接受了国家级专项检查，我市总结创立的“医防结合”、放射科医生与结防医生双签名制度”结核病防控体系和工作模式得到国家充分肯定并推广；2006年代表苏州市高质量通过了江苏省基本消灭疟疾的考核，领先通过了苏州市流动儿童计划免疫达标镇验收，超额完成了苏州市下达的结核病防治任务，实现了慢性病防治以社区为单位的全覆盖；2008年，着力抓好重大传染病防控、突发公共卫生事件应急处置、农村基本公共卫生服务项目、机构能力建设等重点工作，实现了综合管理水平、技术服务能力、项目推进力度和社会综合满意度的全面提升；2009年，以实施国家重大科技专项江苏省传染病综合防治示范区建设项目为龙头，进一步深化疾病预防控制绩效评估考核机制，扎实推进机构能力建设和内涵建设，全面强化重大传染病预防控制、突发公共卫生事件应急处置、公共卫生技术服务等工作职能，实现了全市疾病预防控制工作在更高平台上的科学发展，全市人均期望寿命（80.82岁）接近中等发达国家水平。近年来先后荣获江苏省疾病预防控制工作先进集体和苏州市卫生工作先进集体、劳动关系和谐单位、疾病预防控制工作综合先进等多个奖项。自成立以来连年被张家港市委、市政府授予文明单位称号。 21世纪是充满竞争和机遇的时期，中心将在科学发展观引领下，牢牢把握国家医药卫生体制改革与发展的历史性机遇，紧紧围绕“完善基础设施，强化能力建设，筑牢防病屏障，保障人民健康”目标，以建设现代化疾控中心为核心，坚持与时俱进，以创新的思维、务实的作风、科学的方法，进一步强化疾控内涵建设，抓住突发事件应急体系建设、基本公共卫生服务项目落实、疾控信息化建设等工作重点，充分发挥对全市公共卫生工作的技术核心和辐射指导作用，进一步提升全市疾病预防控制综合能力，深入推进全市公共卫生事业全面、协调、持续发展。